Ο άλλοτε κυρίαρχος και παντοδύναμος Μάτα Νούι, βρίσκεται ξαφνικά σε έναν ερημικό σκουπιδότοπο ανάμεσα σε άχρηστα παλιοσίδερα και σκουριασμένα μέταλλα. Αφού κερδίσει μια πολύ επικίνδυνη Γκλατοριανή μάχη, καλείται να βοηθήσει τους ντόπιους κατοίκους να πολεμήσουν ενάντια στους πραγματικούς εχθρούς: τον σατανικό Σκράαλ και τους Κυνηγούς των Οστών. Ο Μάτα Νούι, με τους γενναίους μονομάχους Γκλατόριαν και τους χωρικούς της ερήμου στο πλευρό του, θα ξεκινήσει για την πιο επική περιπέτεια σε φανταστικούς νέους τόπους που θα αποκαλυφθούν τα πιο τρομερά μυστικά του Bionicle.